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  • 癌癥與免疫系統初探5:腫瘤免疫治療

    基于樹突狀細胞(DC)的腫瘤疫苗耐受性良好,副作用少,可產生抗腫瘤的免疫應答,但從總體而言,它們的好處仍然有限。最近的研究表明,CD141+ DC在抗腫瘤反應中發揮重要作用。直接針對體內DC的疫苗目前正在開發中。 [2017/7/10]

  • PacBio 全長轉錄本測序發現新的前列腺癌生物標志物

    最新一期《Clinical Cancer Research》上刊登了來自美國明尼蘇達大學研究團隊關于前列腺癌腫瘤標志物的最新研究成果,文章題為“Androgen receptor variant AR-V9 is co-expressed with AR-V7 in prostate cancer metastases and predicts abiraterone resistance”。 [2017/7/6]

  • 癌癥與免疫系統初探4:腫瘤微環境

    腫瘤微環境被定義為腫瘤存在的細胞環境。這包括周圍的血管、免疫細胞、成纖維細胞、其他細胞、信號分子以及細胞外基質(ECM)。研究也報道了腫瘤與微環境之間的動態關系。 [2017/7/4]

  • miRNA的測序文庫制備,你需要注意什么?[心得點評]

    miRNA通常是利用RT-qPCR和芯片來研究的,但miRNA測序卻能讓你發現一些新東西。盡管miRNA的測序在本質上與其他RNA相同,但樣本處理時的一些步驟卻是不同的。這篇文章將介紹一些最新的方法,幫助你高效制備miRNA-Seq的文庫。 [2017/6/30]

  • 癌癥與免疫系統初探3:腫瘤免疫編輯

    腫瘤免疫編輯是適應性和先天免疫系統控制腫瘤生長和塑造腫瘤免疫原性的過程。此過程包括三個階段:清除(elimination)、平衡(equilibrium)和逃逸(escape)。 [2017/6/27]

  • 利用PacBio測序檢測與膠質母細胞瘤相關但之前無法確定的結構變異

    為了改善膠質母細胞瘤的基因組DNA樣品的結構變異檢測,金唯智在PacBio Sequel平臺上對人類樣品進行了全基因組測序分析,成功鑒定出近20,000個之前無法確定的結構變異。 [2017/6/5]

  • 靶向富集:讓測序經費花在刀刃上[心得點評]

    以外顯子組為例,它僅占基因組的1%到2%,但卻含有85%的已知致病突變。這么看來,與全基因組測序(WGS)相比,外顯子組測序相當于減少了98%的測序工作。不用說,靶向測序集合(panel)更是大大減輕你的負擔。在此,我們看看研究人員是如何開展靶向富集的,以及他們研究時的考慮因素。 [2017/5/22]

  • 癌癥與免疫系統初探2:T細胞庫和抗體庫

    人體免疫系統提供一種保護作用,來對抗各種各樣的病原體以及腫瘤。這種保護是通過B 細胞和T 細胞表面與致病性或病原體來源的抗原結合的巨大的受體庫來介導的。T 細胞通過表達異二聚體(αβ 或γδ)細胞表面受體(T 細胞受體,或TCR)來介導細胞免疫,這需要異源細胞呈遞與MHC結合的肽段抗原。 [2017/5/18]

  • PacBio將推出新的應用程序,協助稀有變異等分析

    隨著新一代測序的日漸普及,大家手頭的數據越來越多,不過,數據分析也成了更大的難題。為了幫助大家應對挑戰,Pacific Biosciences公司將推出三款新的應用程序,可用于稀有變異、結構變異和微生物WGS的分析。 [2017/5/10]

  • Illumina 靶向測序定制Panel 服務全線開放

    Illumina 針對廣大客戶的需求,在固定內容的試劑盒或靶向集合之外,另推出Panel 定制服務。僅需提供目標區域,即可經由自助在線定制工具或Illumina專業設計服務,獲得個性化的定制Panel。 [2017/4/28]

  • 從ccfDNA中挖掘深度信息,你需要這個一體化方案[新品推薦]

    由于ccfDNA通常以低濃度存在,帶稀有突變或被片段化,故整個流程必須靈敏可靠。QIAGEN為研究人員從ccfDNA中挖掘深度信息提供了必需的一切:一個完整且簡化的流程,覆蓋采集、穩定、分離、分析和數據解釋?炜碤IAGEN的解決方案! [2017/4/24]

  • 多項獨立研究證實了QIAGEN測序平臺的性能

    QIAGEN的新一代測序系統GeneReader NGS System與其他測序儀不同,致力于提供從樣品制備到數據解讀的完整流程,為各類實驗室帶來有意義的NGS數據解讀結果。最近,QIAGEN宣布有5項新的獨立研究發表,證實了GeneReader系統的分析性能和簡便易用。 [2017/4/21]

  • 癌癥研究經驗談3:三位大師暢談高通量測序對臨床研究的影響

    測序技術已大大超出了Carlos Bustamante、Stephen Kingsmore和John Mattick三位博士的預期。如果你在他們的職業生涯的早期詢問他們,是否有一天我們能在一天內測序人類全基因組,他們的反應將分別是:“瘋言瘋語!”,“絕對不可能!币约啊白鰤粢膊桓蚁! [2017/4/17]

  • 在miRNA測序中,別讓接頭二聚體和污染性RNA偷走了您的序列……[新品推薦]

    盡管NGS是發現新miRNA的默認工具,但市面上的文庫制備試劑盒很繁瑣,會引入偏向。因此,qPCR一直是定量miRNA表達的首選技術。如今,QIAseq miRNA Library Kit重新定義了小RNA測序產品,包含了其他測序試劑盒沒有的一些獨特功能。 [2017/4/11]

  • Science最新報道:單細胞測序助跑癌癥精準分型

    麻省綜合醫院(MGH)、MIT布羅德研究所、哈佛大學近日在Science雜志上發表了一篇文章(3月31日),使用單細胞RNA測序技術,并結合癌癥基因組圖譜分析了星形細胞瘤和少突神經膠質瘤兩種腦神經膠質瘤的細胞組成。通過細致全面的基因表達分析,結果顯示兩種腫瘤可能源自同一種神經前體細胞可以通過基因突變類型和微環境組成對該兩種腫瘤進行區分。 [2017/4/1]

  • 新型經濟快捷的基因組測序技術

    美國貝勒醫學院、德克薩斯兒童醫院、麻省理工大學、以及哈佛大學共同組成的研究小組,開發出一種新的基因組測序方法,可以完全從0開始創建人類參考基因組,費用低于1萬美元。 [2017/3/25]

  • Oxford Nanopore推出新款納米孔測序儀,并公開售價[新品推薦]

    英國生物技術公司Oxford Nanopore本周宣布,它的納米孔測序產品家族添加了一個新成員:GridION X5。這個新的系統內最多能夠帶動五個MinION流動槽,并在單臺設備中完成數據處理。 [2017/3/17]

  • 癌癥研究經驗談2:靶向重測序實現了體細胞嵌合的高通量檢測

    Saumya Jamuar博士是新加坡KK婦女兒童醫院的臨床遺傳學家,也是Global Gene公司的聯合創始人,這是一家創新的基因組學研究開發公司。他開創了第一種高通量的系統方法來鑒定與大腦皮質畸形相關的體細胞突變。他利用NGS開展此項研究,使用的是Illumina的MiSeq系統和TruSeq® Custom Amplicon assay。 [2017/3/16]

  • 癌癥研究經驗談1:新一代測序是生物標志物發現的無價之寶

    現在,我們來聚焦一些頂尖的科學機構,看看他們如何利用新工具來改善癌癥的診斷和治療。Georges-François Leclerc中心的實驗室研究人員利用MiSeq®和NextSeq® 500系列來開展RNA-Seq、ChIP-Seq和外顯子組測序,以搜索與癌癥相關的基因表達譜。 [2017/3/2]

  • 癌癥研究必讀5:如何研究癌癥中的基因調控

    新一代測序和芯片技術可監控轉錄組和表觀基因組中的變化。那些在癌癥相關的基因調控中起作用的蛋白-DNA相互作用也能在全基因組水平分析。研究人員在檢測這些調控機制時,有測序和芯片兩種選擇。 [2017/2/16]


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